An energy-aware performance analysis of SWIMM : (Record no. 56592)

MARC details
000 -CABECERA
campo de control de longitud fija 02102naa a2200253 a 4500
003 - IDENTIFICADOR DEL NÚMERO DE CONTROL
campo de control AR-LpUFIB
005 - FECHA Y HORA DE LA ÚLTIMA TRANSACCIÓN
campo de control 20250311170444.0
008 - DATOS DE LONGITUD FIJA--INFORMACIÓN GENERAL
campo de control de longitud fija 230201s2015 xx r 000 0 eng d
024 8# - Otro identificador estandar
Número estándar o código DIF-M7576
-- 7796
-- DIF006816
040 ## - FUENTE DE LA CATALOGACIÓN
Centro catalogador/agencia de origen AR-LpUFIB
Lengua de catalogación spa
Centro/agencia transcriptor AR-LpUFIB
100 1# - ENTRADA PRINCIPAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona Rucci, Enzo
245 10 - MENCIÓN DE TÍTULO
Título An energy-aware performance analysis of SWIMM :
Resto del título Smith-Waterman implementation on Intel's Multicore and Manycore architectures
300 ## - DESCRIPCIÓN FÍSICA
Extensión 1 archivo (2,3 MB)
500 ## - NOTA GENERAL
Nota general Formato de archivo PDF. -- Este documento es producción intelectual de la Facultad de Informática - UNLP (Colección BIPA/Biblioteca)
520 ## - SUMARIO, ETC.
Sumario, etc. Alignment is essential in many areas such as biological, chemical and criminal forensics. The well-known Smith–Waterman (SW) algorithm is able to retrieve the optimal local alignment with quadratic time and space complexity. There are several implementations that take advantage of computing parallelization, such as manycores, FPGAs or GPUs, in order to reduce the alignment effort. In this research, we adapt, develop and tune the SW algorithm named SWIMM on a heterogeneous platform based on Intel’s Xeon and Xeon Phi coprocessor. SWIMM is a free tool available in a public git repository https://github.com/ enzorucci/SWIMM. We efficiently exploit data and thread-level parallelism, reaching up to 380 GCUPS on heterogeneous architecture, 350 GCUPS for the isolated Xeon and 50 GCUPS on Xeon Phi. Despite the heterogeneous implementation obtaining the best performance, it is also the most energy-demanding. In fact, we also present a trade-off analysis between performance and power consumption. The greenest configuration is based on an isolated multicore system that exploits AVX2 instruction set architecture reaching 1.5 GCUPS/Watts.
534 ## - NOTA SOBRE LA VERSIÓN ORIGINAL
Encabezamiento principal del original Concurrency and Computation: Practice & Experience, 27(18), pp. 5517-5537.
653 ## - TÉRMINO DE INDIZACIÓN--NO CONTROLADO
Término no controlado bioinformática
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona García, Carlos Diego
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona Botella, Guillermo
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona De Giusti, Armando Eduardo
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona Naiouf, Ricardo Marcelo
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona Prieto-Matias, Manuel
942 ## - ELEMENTOS DE PUNTO DE ACCESO ADICIONAL (KOHA)
Tipo de ítem Koha Capítulo de libro
Holdings
Estado de retiro Estado de pérdida Estado dañado Disponibilidad Colección Biblioteca permanente Biblioteca actual Fecha de adquisición Total de préstamos Signatura topográfica completa Fecha visto por última vez Identificador Uniforme del Recurso Precio válido a partir de Tipo de ítem Koha
      No corresponde Biblioteca digital Biblioteca de la Facultad de Informática Biblioteca de la Facultad de Informática 11/03/2025   A0800 11/03/2025 http://catalogo.info.unlp.edu.ar/meran/getDocument.pl?id=1493 11/03/2025 Capítulo de libro