Smith-Waterman algorithm on heterogeneous systems : (Record no. 56724)

MARC details
000 -CABECERA
campo de control de longitud fija 01808naa a2200289 a 4500
003 - IDENTIFICADOR DEL NÚMERO DE CONTROL
campo de control AR-LpUFIB
005 - FECHA Y HORA DE LA ÚLTIMA TRANSACCIÓN
campo de control 20250311170448.0
008 - DATOS DE LONGITUD FIJA--INFORMACIÓN GENERAL
campo de control de longitud fija 230201s2014 xx o 000 0 eng d
024 8# - Otro identificador estandar
Número estándar o código DIF-M7602
-- 7822
-- DIF006948
040 ## - FUENTE DE LA CATALOGACIÓN
Centro catalogador/agencia de origen AR-LpUFIB
Lengua de catalogación spa
Centro/agencia transcriptor AR-LpUFIB
100 1# - ENTRADA PRINCIPAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona Rucci, Enzo
245 10 - MENCIÓN DE TÍTULO
Título Smith-Waterman algorithm on heterogeneous systems :
Resto del título a case study
300 ## - DESCRIPCIÓN FÍSICA
Extensión 1 archivo (302,6 kB)
500 ## - NOTA GENERAL
Nota general Formato de archivo PDF. -- Este documento es producción intelectual de la Facultad de Informática - UNLP (Colección BIPA/Biblioteca)
520 ## - SUMARIO, ETC.
Sumario, etc. The well-known Smith-Waterman (SW) algorithm is a high-sensitivity method for local alignments. However, SW is expensive in terms of both execution time and memory usage, which makes it impractical in many applications. Some heuristics are possible but at the expense of losing sensitivity. Fortunately, previous research have shown that new computing platforms such as GPUs and FPGAs are able to accelerate SW and achieve impressive speedups. In this paper we have explored SW acceleration on a heterogeneous platform equipped with an Intel Xeon Phi coprocessor. Our evaluation, using the well-known Swiss-Prot database as a benchmark, has shown that a hybrid CPU-Phi heterogeneous system is able to achieve competitive performance (62.6 GCUPS), even with moderate lowlevel optimisations.
534 ## - NOTA SOBRE LA VERSIÓN ORIGINAL
Encabezamiento principal del original IEEE International Conference on Cluster Computing (2014 : Madrid, España)
650 #4 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA
Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada ALGORITMOS
653 ## - TÉRMINO DE INDIZACIÓN--NO CONTROLADO
Término no controlado Smith-Waterman
653 ## - TÉRMINO DE INDIZACIÓN--NO CONTROLADO
Término no controlado bioinformática
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona De Giusti, Armando Eduardo
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona Naiouf, Ricardo Marcelo
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona Botella, Guillermo
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona García, Carlos Diego
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona Prieto-Matias, Manuel
856 40 - LOCALIZACIÓN Y ACCESO ELECTRÓNICOS
Identificador Uniforme del Recurso <a href="http://dx.doi.org/10.1109/CLUSTER.2014.6968784">http://dx.doi.org/10.1109/CLUSTER.2014.6968784</a>
942 ## - ELEMENTOS DE PUNTO DE ACCESO ADICIONAL (KOHA)
Tipo de ítem Koha Capítulo de libro
Holdings
Estado de retiro Estado de pérdida Estado dañado Disponibilidad Colección Biblioteca permanente Biblioteca actual Fecha de adquisición Total de préstamos Signatura topográfica completa Fecha visto por última vez Identificador Uniforme del Recurso Precio válido a partir de Tipo de ítem Koha
      No corresponde Biblioteca digital Biblioteca de la Facultad de Informática Biblioteca de la Facultad de Informática 11/03/2025   A0824 11/03/2025 http://catalogo.info.unlp.edu.ar/meran/getDocument.pl?id=1520 11/03/2025 Capítulo de libro