Accelerating Smith-Waterman alignment of long DNA sequences with OpenCL on FPGA (Record no. 56866)

MARC details
000 -CABECERA
campo de control de longitud fija 01681naa a2200289 a 4500
003 - IDENTIFICADOR DEL NÚMERO DE CONTROL
campo de control AR-LpUFIB
005 - FECHA Y HORA DE LA ÚLTIMA TRANSACCIÓN
campo de control 20250311170452.0
008 - DATOS DE LONGITUD FIJA--INFORMACIÓN GENERAL
campo de control de longitud fija 230201s2017 xx o 000 0 eng d
024 8# - Otro identificador estandar
Número estándar o código DIF-M7761
-- 7980
-- DIF007090
040 ## - FUENTE DE LA CATALOGACIÓN
Centro catalogador/agencia de origen AR-LpUFIB
Lengua de catalogación spa
Centro/agencia transcriptor AR-LpUFIB
100 1# - ENTRADA PRINCIPAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona Rucci, Enzo
245 10 - MENCIÓN DE TÍTULO
Título Accelerating Smith-Waterman alignment of long DNA sequences with OpenCL on FPGA
300 ## - DESCRIPCIÓN FÍSICA
Extensión 1 archivo (703,6 kB)
500 ## - NOTA GENERAL
Nota general Formato de archivo PDF. -- Este documento es producción intelectual de la Facultad de Informática - UNLP (Colección BIPA/Biblioteca)
520 ## - SUMARIO, ETC.
Sumario, etc. With the greater importance of parallel architectures such as GPUs or Xeon Phi accelerators, the scientific community has developed efficient solutions in the bioinformatics field. In this context, FPGAs begin to stand out as high performance devices with moderate power consumption. This paper presents and evaluates a parallel strategy of the well-known Smith-Waterman algorithm using OpenCL on Intel/Altera’s FPGA for long DNA sequences. We efficiently exploit data and pipeline parallelism on a Intel/Altera Stratix V FPGA reaching upto 114 GCUPS in less than 25 watt power requirements.
534 ## - NOTA SOBRE LA VERSIÓN ORIGINAL
Encabezamiento principal del original IWBBIO 2017. International Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering (2017 : Granada, España)
650 #4 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA
Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada ARQUITECTURAS PARALELAS
650 #4 - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL DE MATERIA--TÉRMINO DE MATERIA
Término de materia o nombre geográfico como elemento de entrada COMPUTACIÓN DE ALTO RENDIMIENTO - HPC
653 ## - TÉRMINO DE INDIZACIÓN--NO CONTROLADO
Término no controlado ADN
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona García, Carlos Diego
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona Botella, Guillermo
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona De Giusti, Armando Eduardo
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona Naiouf, Ricardo Marcelo
700 1# - PUNTO DE ACCESO ADICIONAL--NOMBRE DE PERSONA
Nombre de persona Prieto-Matias, Manuel
856 40 - LOCALIZACIÓN Y ACCESO ELECTRÓNICOS
Identificador Uniforme del Recurso <a href="https://doi.org/10.1007/978-3-319-56154-7_45">https://doi.org/10.1007/978-3-319-56154-7_45</a>
942 ## - ELEMENTOS DE PUNTO DE ACCESO ADICIONAL (KOHA)
Tipo de ítem Koha Capítulo de libro
Holdings
Estado de retiro Estado de pérdida Estado dañado Disponibilidad Colección Biblioteca permanente Biblioteca actual Fecha de adquisición Total de préstamos Signatura topográfica completa Fecha visto por última vez Identificador Uniforme del Recurso Precio válido a partir de Tipo de ítem Koha
      No corresponde Biblioteca digital Biblioteca de la Facultad de Informática Biblioteca de la Facultad de Informática 11/03/2025   A0918 11/03/2025 http://catalogo.info.unlp.edu.ar/meran/getDocument.pl?id=1663 11/03/2025 Capítulo de libro